根又称烂根是育苗期常见病害。主要为害幼苗根部或根茎部。发生沤根时，根部不发新根或不定根，根皮发锈后腐烂，致地上部萎蔫，且容易拔起，地上部叶缘枯焦。严重时，成片干枯，似缺素症。防治方法如下： 
　　1.选用耐病的广优1号、大青皮、车轴皮等优良冬瓜品种和耐寒的菠萝种、耐雨水的冠星2号等节瓜品种。

2.施用酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟有机肥。

3.畦面要平，严防大水漫灌。

4.加强育苗期的地温管理，避免苗床地温过低或过湿，正确掌握放风时间及通风量大小。

5.采用电热线育苗，控制苗床温度在16℃左右，一般不宜低于12℃，使幼苗茁壮生长。

6.发生轻微沤根后，要及时松土，提高地温，待新根长出后，再转入正常管理。7.必要时可喷增根剂。